Kahes kihis maakollektori kaevamisel kasutatakse peaaegu sama süsteemi nagu ka horisontaalsel paigaldusel, ainult selle vahega, et kui on tarvis nt. 600ruutu vaba pinda, aga on ainult 300ruutu siis kaevatakse üks kiht ca 1,8m sügavusele ja ülemine ca 1-1,2m peale.
Olles pidevas vaheldumises ülemine kiht nt. 20m üleval seejärel jälle 20m alumises kihis tagab maapinna temperatuuri ühtluse. Kasutatakse toru pem 40mm 2,4mm.
